Banega nació en Rosario, Santa Fe, el 29 de junio de 1988 donde comenzó a jugar (y destacar) en la escuela infantil Alianza Sport. A los 12 años fue descubierto por el mítico Boca con el que competiría en categorías inferiores hasta que en 2006 Alfio Basile le ofreció la tan ansiada oportunidad con el primer equipo, al cual se sumaría definitivamente un año después con Russo desplazando a Sebastián Battaglia.

Banega debutó con la selección argentina Sub-20 en el Campeonato Sudamericano celebrado en Paraguay con la que obtuvo el segundo puesto por detrás del conjunto carioca, logrando a su vez la clasificación para el Mundial Sub-20 de Canadá de 2007 y para los juegos Olímpicos de Pekín de 2008. El periodismo deportivo le calificó entonces como el sucesor de Fernando Gago; según el diario “La Nación” “no le pesó el debuto, mostró una gran personalidad, actitud para luchar en el medio campo y claridad para distribuir la pelota con corrección”

A principios de 2008 el Valencia CF obtuvo su traspaso por 18 millones de euros para el proyecto del nuevo Valencia de Ronald Koeman por encima de las propuestas de otros grandes europeos como la Juventus de Turín, el Atlético de Madrid o incluso el Real Madrid que tenía una opción preferente sobre el jugador que no ejerció. El propio Ever reconoce que su llegada al fútbol español fue un sueño hecho realidad. Debutaría con el conjunto “ché” el 13 de enero de 2008 frente al Atlético de Madrid